Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC38Q5VT99 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC38Q5VT99 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms