Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms