Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC44A4Q53GD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms