Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUS10Q3MIT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS10Q3MIT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms