Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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ATXN8Q156A1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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ATXN8Q156A1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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ATXN8Q156A1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ATXN8Q156A1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATXN8Q156A1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATXN8Q156A1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATXN8Q156A1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATXN8Q156A1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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