Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX1Q15475 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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