Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SF3A1Q15459 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3A1Q15459 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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