Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCM1Q15154 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCM1Q15154 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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