Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCAPHQ15003 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPHQ15003 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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