Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PMS2P11Q13670 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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