Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC1Q13547 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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