Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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