Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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