Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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