Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA3Q08378 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.14
GOLGA3Q08378 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms