Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms