Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP1P56182 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP1P56182 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP1P56182 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP1P56182 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP1P56182 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP1P56182 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP1P56182 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP1P56182 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP1P56182 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP1P56182 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP1P56182 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP1P56182 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRP1P56182 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRP1P56182 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP1P56182 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms