Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-18■■■■■ 27.9
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SUB1P53999 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 27.8
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SUB1P53999 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 27.4
SUB1P53999 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.985e-8■■■■■ 27.4
SUB1P53999 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-8■■■■■ 27.4
SUB1P53999 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 25.63□□□□□ -1.515e-8■■■■■ 27.4
SUB1P53999 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.535e-8■■■■■ 27.4
SUB1P53999 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.379e-13■■■■■ 27.4
SUB1P53999 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.49e-13■■■■■ 27.4
SUB1P53999 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 23.75□□□□□ -1.819e-13■■■■■ 27.4
SUB1P53999 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 27.4
SUB1P53999 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 27.4
SUB1P53999 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 59.79□□□□□ -0.841e-10■■■■■ 27.4
SUB1P53999 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 27.3
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SUB1P53999 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 27.3
SUB1P53999 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 27.3
SUB1P53999 PRMT5-207ENST00000476175 682 ntTSL 25.32□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 27.3
SUB1P53999 PRMT5-226ENST00000557443 337 ntTSL 34.69□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 27.3
SUB1P53999 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 27.3
SUB1P53999 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 27.3
SUB1P53999 ZNF330-203ENST00000506302 1180 ntTSL 29.16□□□□□ -0.946e-32■■■■■ 27.2
SUB1P53999 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 514.54□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 27.2
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