Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK4P51957 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK4P51957 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK4P51957 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK4P51957 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK4P51957 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK4P51957 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms