Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC4P43686 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms