Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms