Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms