Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4AP40617 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms