Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RABGAP1L-220ENST00000529145 722 ntTSL 46.88□□□□□ -1.316e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.496e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 220.15■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 418.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 412.61□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 412.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 210.26□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 49.57□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 48.89□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 58.71□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 424.59■■□□□ 1.536e-8■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.21■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 416.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-209ENST00000447472 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 416.34■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-204ENST00000415337 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.18■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.824e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.467e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 FBXW4-202ENST00000457105 630 ntTSL 518.95■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 219.04■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.014e-6■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PROC-202ENST00000402125 779 ntTSL 219.6■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 32.4
GTF2F1P35269 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 414.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.46e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.876e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 520.67■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.786e-9■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.126e-9■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 AC116025.1-202ENST00000570952 381 ntTSL 213.01□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 322.14■■□□□ 1.138e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 421.06■□□□□ 0.968e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.888e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 320.32■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.728e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 223.61■■□□□ 1.378e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.278e-7■■■■■ 32.3
GTF2F1P35269 ITGA5-213ENST00000553071 1013 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 32.2
GTF2F1P35269 ITGA5-202ENST00000435631 1240 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 32.2
GTF2F1P35269 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 32.2
GTF2F1P35269 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 216.6■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 32.2
GTF2F1P35269 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 316.02■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TOR1A-202ENST00000473084 1668 ntTSL 1 (best)20.9■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.349e-9■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.389e-9■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.29e-9■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TCF25-208ENST00000563032 274 ntTSL 222.76■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 322.44■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TCF25-203ENST00000561585 981 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 518.49■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.435e-9■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 317.07■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 412.94□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 226■■□□□ 1.756e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.656e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.93□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.93□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 32.1
GTF2F1P35269 COLGALT1-203ENST00000597075 737 ntTSL 217.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 32
GTF2F1P35269 FAM95C-204ENST00000637322 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.04■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 FAM95C-203ENST00000637288 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.83■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 FAM95C-202ENST00000636756 654 ntTSL 27.6□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-210ENST00000608272 612 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-213ENST00000622120 355 ntTSL 513.85□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 32
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 110.3 ms