Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFSF4P23510 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms