Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VEGFAP15692 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms