Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCSHP14314 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCSHP14314 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms