Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2BP0DMP2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms