Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms