Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNTO95613 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNTO95613 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNTO95613 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNTO95613 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNTO95613 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNTO95613 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNTO95613 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNTO95613 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNTO95613 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNTO95613 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNTO95613 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNTO95613 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNTO95613 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNTO95613 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNTO95613 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms