Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPG5O95196 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms