Protein–RNA interactions for Protein: O95158

NXPH4, Neurexophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH4O95158 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXPH4O95158 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms