Protein–RNA interactions for Protein: O94868

FCHSD2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHSD2O94868 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCHSD2O94868 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCHSD2O94868 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms