Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM2O94769 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM2O94769 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM2O94769 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM2O94769 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM2O94769 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM2O94769 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM2O94769 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM2O94769 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM2O94769 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM2O94769 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms