Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR3O43761 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms