Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM6BO15054 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM6BO15054 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms