Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN5O00501 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms