Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM90A7PA6NKC0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM90A7PA6NKC0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms