Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB19A4D1S5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms