Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HMX2A2RU54 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX2A2RU54 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms