Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN16Q9Y5I7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms