Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COQ4Q9Y3A0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COQ4Q9Y3A0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms