Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms