Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGTPBP1Q9UPW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGTPBP1Q9UPW5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGTPBP1Q9UPW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms