Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PARP4Q9UKK3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP4Q9UKK3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms