Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA1Q9UJY5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms