Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCF2Q9UG63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms