Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN3Q9P232 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms