Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SACSQ9NZJ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms