Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VNN3Q9NY84 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms